《超级机器人大战·原创世纪》的背景是新西历，人类正式开始进出宇宙2世纪，但因为2次大型陨石的坠下，人们的生活还是维持在21世纪初。到了新西历179年，第3颗陨石“流星3(メテオ3)”坠落于南太平洋

2014年，讨厌机械的高中生·夏目亮为了改变自己而迈出了那一步。然而，他却死于卡车之下——。然后2030年的东京港湾，潜入了未知兵器“EX-ARM”的交易现场的警察·上园美波与人造人·阿尔玛这一搭档遭

4年了，距离那场私人武装组织——天人与人类联盟军的决战过去4年了。

自从宇宙战舰大和号从那场单程长达16万8000光年、通往伊斯坎达尔的壮大航海中回归以来，已经过了3年—在“宇宙恢复系统”之下取回先前蓝色样貌的地球。

供职于制药公司的小职员田中信男拖着病体赶回公司，无意中服用了公司与军方合作的实验药品。自此信男成为了制造致命臭气的肉身工厂，对此毫不自知的信男却按照上司命令将药品样本送往东京总部，一路上引起大面积

　　U.C.（宇宙世纪）0079年，人类向宇宙发展并建立了多个巨大的卫星，让人类能够居住在宇宙中。卫星的居民们不堪忍受地球联邦政府对其剥削和压迫，遂宣布独立，更组建军队与地球联邦政府决一雌雄。在战争中

关键字：“恋爱”、“冒险”、“主人样”和“使魔”。在异世界哈尔凯尼亚被当作“使魔”被召唤出来的高中生平贺才人卷入了一场满载这四种元素的幻想罗曼史大冒险中。将才人召唤至异世界的是长相可爱却没有丝毫魔法才

被卷入异世界的才人，一直寻找着回到原来世界的方法。终于有一天，他遇到了能够回到日本的千年一遇的好机会，但是，才人为了拯救陷入危机的主人露依斯，果断地放弃了这个机会留了下来，最终依然选择作为贫乳的使魔生

这是一个美苏两个超级大国仍然在明争暗斗的时代，分成东西两大阵营的人类虽然没有进行大规模的军事行动，但是在不为人知的背后世界里，各国的情报人员正进行着残酷异常的间谍战。相良宗介中士是神秘的国际组织米斯利

三日月・奥格斯所属的铁华团，在从护送古荻莉亚・蓝娜・伯恩斯坦到地球时，在阿布罗代表提名选举中一战成名。他们在那场战斗中揭露了加拉尔霍恩的腐败，虽不明显但世界正因此确实地改变着。藉由和阿布罗交涉所获得的